Здание является одной из старейших сохранившихся мечетей в Центральной Азии и одним из немногих бухарских зданий, не разрушенных монголами. В 12-13 веке здание было существенно перестроено. Нижний портал также датируется этим временем. Со временем мечеть, расположенная в яме, все больше погружалась под культурные слои города. Поэтому в 16 веке был построен еще один портал, который в то время находился на одном уровне с землей (примерно на 4,5 метра выше, чем изначальный портал). В 1930-х годах здание было окончательно раскрыто и восстановлено.
Мечеть имеет прямоугольную форму площадью 12 на 7,5 метров. Оригинальный портал слегка асимметричен и обрамлен на плоской крыше двумя восьмиугольными барабанами, которые также оснащены восьмиугольными куполами. Наиболее богато украшен первый портал орнаментом из специально вырезанных и выложенных плиток. В основном здесь использовались геометрические узоры.
Название мечети восходит к доисламским временам. Уже в то время на этом месте была яма («Магок»). Был также небольшой базар, где в основном продавались специи и травы. Отсюда вытекает вторая часть названия: термин «Аттар» означает «торговец ароматами» или же «торговец специями».
Сегодня в мечети расположился музей ковров.