Биби-Ханым – самая большая историческая мечеть самарканда и Центральной Азии
Для выбора правильного места и времени строительства советовались с астрологами, как это было принято. Тимур время от времени сам руководил строительством, а иногда и выражал недовольство; например, по его указу был снесен первоначальный портал, потому что он казался слишком маленьким по отношению к главному куполу над молитвенным залом.
День и ночь трудились рабочие, и за 5 лет строительство мечети была завершено. Одна из характерных особенностей этого периода – огромные размеры и пропорциональность. Это обстоятельство и привело к возникновению проблем. Здание начало постепенно разрушаться. Причиной этому послужили очень большие размеры здания, которые просто не выдержали давления. Даже укрепление стен не помогло, так как вскоре первые кирпичи стали выпадать из стен. Также сейсмическая активность Самарканда сыграло свою роль. К 17 веку мечеть уже была заброшена и не функционировала, а к 19-му веку оказалась в руинах.

Лишь в советское время руины были законсервированы и позже начались восстановительные работы. Начиная с 60-х годов и по настоящее время, здесь проводятся реставрационные и консервационные работы.
Археологи и историки внесли свой вклад в описание первоначального облика мечети. Мечеть имеет двор, по периметру которого шла купольно-арочная галерея, поддерживаемая примерно 400 колоннами. Здание имеет три помещения для молитв, которые можно и сегодня увидеть. Первоначально здание имело четыре высоких минарета и двух небольших восьмиугольных башен на каждом из двух порталов, однако они сохранились лишь частично.
Легенда о Биби-ханым
Название мечети означает «святая госпожа» и согласно легенде, связано со старшей женой Тимура — Сарай Мульк Ханым. Она была доверенным лицом Тимура и даже консультировала его по политическим вопросам. Во время военных походов Тимура, на нее была возложена обязанность, контролировать строительство мечети, и она была полна решимости завершить ее до возвращения своего мужа из очередного военного похода.

Она торопила строительство, но архитектор не хотел этого делать, так как придерживался норм архитектурной постройки. Тогда Биби-Ханым предлагает ему любые богатства, какие он пожелает. Однако молодой архитектор уже был влюблен в саму царицу, и просит ее поцелуй. Жена Тимура отвергает его просьбу, и взамен предлагает любую девушку из ее окружения, объясняя это тем, что, если взять корзину с разноцветными яйцами, на вид они разные, но когда разобьешь их, начинка одинакова. Ответ юноши был «если взять два бокала, в один налить воду, а в другой вино, на вид они похожи, но вкус у них разный». Тем самым давая понять, что он хочет получить поцелуй именно царицы. Оказавшись в неизбежном положении, королева согласилась и позволила архитектору поцеловать себя в щеку. Поцелуй оказался настолько страстным, что оставил след на ее щеке.
Вернувшись в Самарканд, Тимур смог насладиться видом законченной мечети, но также заметил пятно на лице своей суженной. Он приказывает казнить архитектора, к чему тот уже был готов. Он соорудил себе крылья, взобрался на один из минаретов мечети, и, взметнув, улетел по направлению к Персии.